Фамилия Белошеина — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не профессия, а внешняя примета, закреплённая в прозвище. Она образована от слов «белый» и «шея»: Белошей, Белошея — так на Руси могли прозвать человека со светлой, чистой кожей на шее или того, кто носил белый воротник, выделявшийся на фоне одежды. В крестьянской среде, где шея быстро загорала и пачкалась в работе, такая примета была заметной и запоминающейся.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Белошеин — «сын Белошеи» или «из семьи Белошея». Это типичная модель для русских фамилий, образованных от прозвищ на -а/-я (как Головин, Ногин). Важно, что фамилия сохранила мягкое окончание —ин, а не застыла в форме Белошеев, что говорит о древности прозвищной основы: в северных и центральных говорах формы на -ея (-еин) встречаются чаще.

Географически фамилия тяготеет к Вятке и Пермскому краю. В переписях XVIII–XIX веков Белошеины встречаются среди государственных крестьян и бывших монастырских работников. Например, в ревизских сказках Слободского уезда Вятской губернии записаны крестьяне Белошеины — это подтверждает, что фамилия не была дворянской и не имела отношения к служилому сословию.

Стоит различать Белошеина и однокоренную Белошеева. Второй вариант — от прозвища Белошей (с твёрдым окончанием), и он распространён шире. Белошеина же — более локальная форма, возможно, с оттенком уменьшительности или диалектной особенности. Встречается и вариант Белошейкин — от того же корня, но с суффиксом -к-, указывающим на прямое родство: «сын Белошейки».

Фамилия не имеет отношения к «белошвейке» (швее белья) — это народная этимология, не подтверждённая историческими данными. Белошеины — это потомки человека, которого в деревне запомнили по белой шее, и прозвище закрепилось за целым родом.