Фамилия Бенеков — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет привычного славянского корня, который сразу подсказал бы ремесло или внешность предка. Суффикс -ов указывает на русскую модель образования: такую фамилию давали по отцу, то есть по имени или прозвищу Бенек. Но что стоит за этим Бенеком?

Самая вероятная версия — немецкое или прибалтийское происхождение. Основа Бенек (Bennek) — это краткая форма от имени Бенедикт (Benedikt), популярного в немецкоязычных землях. В России фамилии на -ов, образованные от иноязычных имён, часто встречались у обрусевших немцев, выходцев из Прибалтики или у крещёных татар, где имя Бенек могло быть адаптацией тюркского прозвища. В пользу немецкого корня говорит и то, что фамилия Бенеков встречается в Поволжье и на Урале — регионах, куда в XVIII–XIX веках переселяли немецких колонистов.

Менее распространённая версия связывает Бенекова с тюркским словом «бенек» — «родинка» или «пятно». В этом случае прозвище Бенек давали человеку с заметной родинкой на лице или теле. Однако такая трактовка спорна: суффикс -ек в тюркских языках скорее даёт уменьшительную форму, а не самостоятельное прозвище, и фамилии с корнем «бенек» у тюркских народов почти не фиксируются.

Важно, что фамилия Бенеков не входила в число дворянских — её носители в основном были мещанами, крестьянами или однодворцами. В документах XIX века Бенековы упоминаются в Воронежской и Саратовской губерниях, что подтверждает связь с немецкими колониями Поволжья. Если ваш предок носил эту фамилию, скорее всего, он был потомком переселенца из немецких земель, чьё имя Бенек (от Бенедикта) русифицировали, добавив типичное русское окончание.