Фамилия Бердецкий — одна из тех, что сразу выдают географическое происхождение. Её суффикс -ецк- (в варианте -цк-) указывает на то, что предок носителя фамилии был выходцем из населённого пункта с названием Берда, Берды, Бердец или похожим. Такие фамилии (на -ский/-цкий) в Польше, на Украине и в западных регионах России обычно получали помещики, шляхта, а позже — и крестьяне, переселявшиеся из одного села в другое. В данном случае корень «берд-» почти наверняка связан с тюркским словом «берды» — «дал, дар» (от глагола «бермек»), что нередко встречается в гидронимах и топонимах на юге Украины и в Причерноморье.

Самая прямая версия — связь с рекой Берда, которая впадает в Азовское море в Запорожской области. На её берегах стояли села Берды (ныне Бердянск) и хутора с похожими названиями. Жителей этих мест называли «бердскими», а при переходе в фамилию форма «Бердецкий» закрепилась как указание на выходца «из Берды» или «с Берды». Менее вероятна, но возможна связь с польским топонимом Берде (например, в Люблинском воеводстве), откуда фамилия могла прийти вместе с переселенцами-католиками.

Если отбросить географию, остаётся редкая версия, что в основе лежит прозвище от диалектного «берда» — деталь ткацкого станка (бердо). Но тогда фамилия звучала бы как Бердов или Бердин, а суффикс -ский для прозвища по ремеслу нехарактерен. Поэтому правдоподобнее именно топонимическое происхождение.

Фамилия не относится к числу массовых и чаще встречается на Украине (особенно в Запорожской и Днепропетровской областях), а также среди потомков украинских переселенцев в Сибири и на Дальнем Востоке. В дворянских родословных книгах Бердецкие не значатся — скорее всего, это фамилия однодворцев, казаков или мещан, получивших её при переписях по месту жительства.