Фамилия Берникова образована от прозвища Берник, которое восходит к старинному слову «берно», то есть «бревно». Однако не исключено, что такое прозвище мог получить коренастый, дюжий человек или же тот, кто отличается малоподвижным образом жизни. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Берник, со временем получил фамилию Берникова.