Фамилия Беспелюхин — редкий случай, когда прозвище не просто дали человеку, а закрепили за ним в качестве фамильного имени, почти не изменив. Основа здесь — слово «беспелюхий», то есть «без пелюх». В русских говорах «пелюха» означала либо мякину, полову (отходы при обмолоте), либо — в более грубом, переносном смысле — нечто негодное, пустое, а также могла относиться к неряшливому или нерасторопному человеку. В словаре В. И. Даля «пелюха» — это ещё и «кулёк, мешочек», но в прозвищной модели скорее работала отрицательная коннотация.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Беспелюхин — сын Беспелюхи. Такая модель типична для фамилий, образованных от прозвищ с окончанием на -а/-я, которые в быту склонялись как существительные женского рода, независимо от пола носителя. То есть прозвище Беспелюха (человек без пелюх, без мякины — возможно, чистоплотный, или же, наоборот, тот, кто не держит в хозяйстве даже отходов) дали отцу, а его дети стали Беспелюхиными.

Интересно, что фамилия практически не встречается в центральных и южных губерниях России. Основной ареал — северные и северо-восточные области: Вологодская, Архангельская, Кировская. Это наводит на мысль, что прозвище закрепилось в локальном говоре, где слово «пелюха» имело более узкое, бытовое значение. Возможно, в этих краях «пелюхой» называли особую верхнюю одежду или мешок для зерна, и «беспелюхий» — это тот, кто ходит без такой одежды или не имеет мешка, то есть бедняк.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Пелюхов, Пелюхин, Пелюх) показывает, что основа «пелюх-» сама по себе редкая и почти не вышла за пределы северного наречия. Беспелюхин — не просто вариант, а отрицательная форма, что делает фамилию вдвойне любопытной: она не описывает качество напрямую, а указывает на отсутствие предмета или свойства. Скорее всего, предок носителя был либо человеком незавидного достатка (без мешка, без половы), либо получил прозвище за необычную опрятность — без сора, без мякины.