Фамилия Бейноева — женская форма фамилии Бейноев, и её происхождение стоит искать в мужском варианте. Основа здесь — слово или прозвище «Бейной», а суффикс «-ев» указывает на принадлежность: «чей?» — Бейноев, то есть сын или потомок Бейноя. Такая модель типична для русских фамилий, но сама основа явно не славянская.

Скорее всего, корень восходит к тюркским языкам, распространённым на Северном Кавказе и в Поволжье. «Бей» — это титул, означающий «господин», «князь», «вождь» (ср. турецкое «bey»). Вторая часть «-ной» может быть вариантом слова «ной» (свет, сияние) или усечённым именем, например, от «Бей-Ной» — «сияющий господин». В чеченском и ингушском языках «бей» также встречается в именах и фамилиях, часто указывая на знатное происхождение или лидерство. Таким образом, Бейноев — это русская по форме, но тюркско-кавказская по корню фамилия, означающая «потомок Бейноя», где Бейной — человек, связанный с титулом или прозвищем «бей».

Встречается фамилия преимущественно у народов Северного Кавказа, особенно у чеченцев и ингушей, где распространены фамилии на «-ев» и «-ов», образованные от местных имён. Возможно, предки носителя фамилии были уважаемыми старейшинами или военными предводителями, так как титул «бей» в тюркской традиции давался не каждому. Редкость фамилии Бейноева (в отличие от более частых Бейсултанов или Бейтуганов) говорит о том, что род мог быть локальным, связанным с конкретным тейпом или селением.

С точки зрения словообразования, интересно, что суффикс «-ев» здесь присоединён к основе, оканчивающейся на «й», что даёт написание через «е»: Бейноев, а не Бейнов. Это указывает на то, что в исходном прозвище или имени был гласный звук между «й» и «н» — возможно, «о» или «а», который в русской передаче превратился в «о» под ударением. Встречаются и варианты написания, например, Бейнаев, но Бейноев — более точная фиксация произношения. Если искать параллели, то можно вспомнить фамилию Бейнорович, где корень тот же, но суффикс другой, что подтверждает реальность основы «Бейно».