Фамилия Билдушкин — редкий случай, когда основа почти наверняка уводит в диалектную лексику северо-запада России. Если отбросить суффикс -ин (указывающий на принадлежность: «чей?» — сын Билдушки), остаётся корень «билдушк-». Прямого аналога в литературном русском языке нет, зато в псковских и тверских говорах встречается слово «билдушка» — так называли болтуна, пустомелю или человека, который говорит невпопад. Слово звукоподражательное, от «биль-биль» или «бал-бал», как лепет или бессвязная речь.

Менее вероятная, но возможная версия — искажение от «бильдюга» (неповоротливый, грузный человек) или от прозвища Билдуй, которое фиксировалось в новгородских писцовых книгах. В любом случае, перед нами не крестильное имя и не ремесло, а прозвище по характеру или манере поведения. Суффикс -ушк- придаёт слову уменьшительно-пренебрежительный оттенок, так что прозвище Билдушка могли дать не столько взрослому, сколько подростку или болтливому парню.

Фамилия почти не встречается за пределами Псковской области и смежных районов Новгородчины. В современных телефонных справочниках и базах данных — единичные записи, что подтверждает её локальный, а не общерусский характер. По сословной принадлежности: судя по окончанию -ин и отсутствию дворянских родовых книг, Билдушкины — скорее всего, крестьяне или мещане, получившие фамилию при переписях XIX века по прозвищу главы семьи.

Однокоренных фамилий почти нет. Можно вспомнить разве что Билдин или Билдуев, но они образованы от других основ. Билдушкин стоит особняком — и по редкости, и по прозрачной, хоть и диалектной, внутренней форме.