Фамилия Биликтуева образована от мужского имени Биликтуй. В основе лежит бурятское слово «билиг» — ум, талант, дарование. Суффикс -туй в бурятском языке образует имена со значением «обладающий чем-либо»; соответственно, Биликтуй — «умный», «одаренный», «талантливый». Аналогичная модель встречается в бурятских именах Гарматуй (от «гарма» — искра), Доржитуй (от «доржи» — алмаз). Русский суффикс -ев, присоединенный к основе, — стандартный способ адаптации нерусских фамилий в патронимическую модель, принятую в Российской империи: Биликтуй → сын Биликтуя → Биликтуев.

Фамилия отчетливо указывает на бурятское происхождение предков. Биликтуевы — это потомки человека, которого в роду помнили как умного или мудрого. Географически фамилия наиболее характерна для Бурятии, Иркутской области и Забайкальского края. Встречается она и среди агинских бурят. Женская форма Биликтуева — это не отдельная фамилия, а грамматический вариант, закрепившийся за женщинами в русской паспортной системе.

Ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог: Били́ктуева, хотя в устной речи возможны колебания под влиянием исходного имени. В дореволюционных метрических книгах фамилию могли записывать как Биликтуевъ, а в редких случаях — как Биликтуев (с окончанием -ев, а не -ов, что подтверждает её бурятскую, а не тюркскую основу).