Фамилия Благополучный — редкий пример, когда в основе лежит не прозвище по характеру или внешности, а оценка успеха. В прямом значении «благополучный» означает «счастливый, удачный, благоуспешный». Вряд ли так называли человека, которому просто везло в жизни: скорее всего, прозвище давали в учебной среде.

Самая вероятная версия — семинарское происхождение. В духовных училищах и семинариях XIX века ученикам нередко присваивали фамилии по успеваемости или поведению. Отличника, который шёл «благополучно» по всем предметам, могли записать как Благополучного. По той же модели из прилагательного «розовый» (от розы) делали фамилию Розов, хотя по строгим правилам суффикс -ов присоединяется к словам мужского рода. Здесь сработала та же логика: нарицательное прилагательное стало фамилией напрямую, без промежуточного существительного.

Суффикс -ый в фамилии Благополучный — не типичный для русских фамилий формант. Чаще встречаются Благополучнов или Благополучников, но форма с окончанием -ый указывает на более позднее, возможно, книжное закрепление. Такие фамилии нередко оставались у выходцев из духовного сословия, где прилагательное в мужском роде воспринималось как естественное.

Точное время возникновения фамилии установить сложно: массовое присвоение семинарских фамилий пришлось на первую половину XIX века. География бытования фамилии Благополучный — преимущественно центральные и южные губернии Российской империи, но без серьёзных генеалогических изысканий определить конкретный регион происхождения рода невозможно.