Фамилия Богоутдинов — один из наглядных примеров того, как арабское имя обрастало русским суффиксом и меняло написание под влиянием местных говоров. В основе лежит мужское имя Багаутдин (араб. Баха ад-Дин — «сияние веры» или «красота религии»). Фамильный суффикс -ов стандартно присоединялся к именам на согласный, образуя притяжательное значение «сын такого-то» или «из семьи такого-то».

Главная особенность Богоутдиновых — замена первой гласной а на о. Это не случайная описка, а устойчивая черта, объяснимая по-разному. В «окающих» говорах Поволжья, где татарское население издавна соседствовало с русским, безударное а часто произносилось как о, и это закреплялось на письме. Вторая возможная причина — ошибки при регистрации в метрических книгах: писарь, не знакомый с арабской фонетикой, записывал имя на слух. В любом случае форма Богоутдинов закрепилась и стала самостоятельной фамилией, а не просто искажением.

Самый ранний из известных носителей — Абдрахман Богоутдинов, родившийся в 1873 году в селе Собачий Остров Симбирской губернии (татарин). Чуть позже, в 1913 году, в селе Старый Бограт Казанской губернии родился Александр Нуртдинович Богоутдинов, тоже татарин. Оба примера показывают, что фамилия бытовала в среде татар-мусульман в Среднем Поволжье, а арабское имя-основа попало в эти края вместе с исламом.

С точки зрения словообразования фамилия устроена просто: корень Богоутдин- (арабское имя, записанное в «окающей» традиции) + суффикс -ов. Ударение, судя по произносительной норме, падает на третий слог: Богоутди́нов.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то любопытно, что в той же среде встречаются варианты Багаутдинов (с сохранением а) и Багаутдинов-Богоутдинов (двойное написание в документах). Но Богоутдинов — не просто дублет, а форма, за которой стоит своя история произношения и записи. Географически она плотнее всего привязана к территории бывших Казанской и Симбирской губерний, где «оканье» было нормой для местных русских говоров.