Фамилия Богоутдинов происходит от арабского мужского имени Багаутдин, что означает «сияние религии». Это составное имя: «бага» (блеск, сияние) и «дин» (вера, религия). В русском языке имя видоизменилось: гласная «а» в начале перешла в «о» — под влиянием «окающих» говоров или из-за ошибок писцов при записи. Так и получилась форма Богоутдинов.

По своему типу фамилия относится к древним восточным, которые вошли в русский обиход через тюркскую среду. Корни уходят в XV–XVII века, когда выходцы из Золотой Орды — печенеги, половцы — оседали на русских землях и принимали православие. Многие из них вливались в дворянское сословие, и их имена, прозвища и отчества ложились в основу фамилий. Именно этот исторический процесс объясняет, почему арабское по происхождению имя стало основой для русской фамилии с типичным суффиксом -ов.

В документах начала XX века фамилия встречается в Симбирской и Казанской губерниях. Например, Богоутдинов Абдрахман (1873 года рождения, из села Собачий остров) и Богоутдинов Александр Нуртдинович (1913 года рождения, из села Старый Бограт) — оба указаны как татары. Эти записи подтверждают, что носителями фамилии были в основном татары и, вероятно, другие тюркские народы Поволжья.

Фамилия Богоутдинов — не просто родовое имя, а памятник восточной письменности и культуры, который через язык и историю связывает арабский Восток, тюркскую степь и русскую равнину.