Фамилия Богумбаева — женская форма фамилии Богумбаев, и чтобы понять её происхождение, нужно разобрать мужской вариант. Основа здесь — «Богумбай». Это составное имя тюркского происхождения, распространённое у казахов, киргизов, татар и других народов. Первая часть, «Богу», восходит к слову «бог» (в значении «бык», «сильный», «могучий»), а вторая — «бай» означает «богач», «хозяин», «господин». Таким образом, Богумбай — это «богатый и сильный, как бык», или «могучий хозяин». В тюркской ономастике такие имена давали с пожеланием ребёнку физической силы, богатства и влиятельности.

Фамилия образована по русской модели патронимического суффикса -ев, который присоединялся к основе, оканчивающейся на -й. В XIX–XX веках, при русификации имён и фамилий в Средней Азии и Казахстане, тюркские имена часто получали русские фамильные окончания. Богумбаев — это буквально «сын Богумбая» или «потомок Богумбая». Важно, что фамилия не связана со славянским словом «бог» — это чисто тюркская лексема, хотя внешне может напоминать что-то христианское.

Географически фамилия Богумбаева чаще всего встречается в Казахстане, особенно в южных и западных областях, а также среди диаспор в России и Узбекистане. В советских документах встречаются варианты написания с одной «м» — Богубаева, но форма с удвоенной «м» более точна, так как отражает тюркское произношение (с долгим «г» или «гх»). Предки носительницы этой фамилии, скорее всего, были скотоводами или земледельцами, а имя Богумбай могло стать родовым прозвищем для целого аула.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то можно вспомнить Богубаев (с тем же корнем, но без удвоения) или более редкие формы вроде Богумбаевой. Встречается и вариант Богумбай, который не получил русского суффикса и остался в виде чистого имени-фамилии. Поскольку фамилия сравнительно редкая, её носители, вероятно, могут проследить свою родословную до конкретного предка по имени Богумбай, жившего не раньше XVIII–XIX веков — времени активного формирования фамилий у тюркских народов.