Фамилия Богушенкова — женская форма от Богушенков, и её разбор стоит начать с суффикса, который сразу выдаёт географию. Суффикс -енков характерен для южнорусских и украинских земель, особенно для Курской, Воронежской, Белгородской областей и Слобожанщины. В центральной России чаще встречались фамилии на -ов/-ев, а на юге прижилась уменьшительно-патронимическая модель с -енко, которая затем обрусела до -енков. То есть Богушенков — это «чей-то сын Богушенко», а Богушенко, в свою очередь, — «сын или потомок Богуша».

Основа фамилии — имя Богуш. Это не полное православное имя, а народная сокращённая форма от Богдан. В украинской и белорусской традиции имя Богдан (буквально «данный Богом») часто укорачивали в быту до Богуш, Богусь или Богдаш. Соответственно, Богушенков — это «внук или потомок Богдана». Вторая возможная версия, менее вероятная, — связь с прозвищем Богуш от слова «бог»: так могли назвать набожного человека или того, кто часто поминал Бога в речи. Но ономастика склоняется к первому варианту: имена-композиты с корнем «бог» (Боголюб, Богуслав, Богдан) дали множество уменьшительных форм, которые осели в фамилиях.

Интересная деталь: написание через «е» — Богушенков, а не Богушонков — указывает на то, что в основе лежала форма Богушенко, а не Богушонко. В украинских говорах суффикс -енко мог произноситься как -енко, но на письме закрепился именно через «е». Когда фамилия перешла в русскую среду и получила окончание -ов, буква «е» сохранилась. Если бы фамилия образовалась напрямую от прозвища «Богуш» с русским суффиксом -ов, мы бы имели Богушов, а не Богушенков. Так что перед нами типичный случай миграции южнорусской фамилии на север, где она адаптировалась под местные патронимические модели.

Сословная принадлежность носителей фамилии в прошлом — скорее крестьянская или казачья. Фамилии на -енков в массе своей принадлежали не дворянам, а свободным землепашцам, однодворцам и казакам южных окраин. Сегодня фамилия встречается нечасто, её можно найти в Курской, Белгородской областях, а также среди потомков переселенцев в Сибири и на Дальнем Востоке.