Фамилия Бомотова, скорее всего, женская форма от фамилии Бомотов. В основе лежит прозвище или мирское имя Бомот. Слово «бомот» в русских говорах — редкое, но фиксируемое. В словарях русских народных говоров оно означает «болтун», «пустомеля» или «человек, который говорит невпопад, бормочет». Глагол «бомотать» или «бомотить» в некоторых регионах значил «говорить неясно, бормотать». Следовательно, прозвище Бомот могли дать неразговорчивому человеку, который мямлил, или, наоборот, тому, кто много и бестолково болтал.

Модель образования типична для русских фамилий: суффикс -ов (-ова) указывает на принадлежность («чей?» — сын или дочь Бомота). Это отчество-прозвище, закрепившееся как фамилия. Важно, что фамилия не имеет связи с тюркскими или иными иноязычными корнями, как можно было бы предположить по звучанию. Это исконно русское образование от диалектного слова.

География фамилии Бомотовых узкая. Основные очаги — северные и центральные области России, особенно Вологодская и Архангельская губернии, где диалектное слово «бомот» было в ходу. Встречается также в Поволжье, но реже. Носители фамилии — потомки крестьян или посадских людей, получивших прозвище по речевой особенности. Сословная принадлежность — почти исключительно крестьянство, так как фамилия не попала в дворянские родословные книги.

Интересная деталь: фамилия Бомотов/Бомотова могла писаться и как Бомотовъ (с «ять» в окончании), что в дореволюционных документах иногда путали с фамилией Баматов (от имени Бамат). Но это разные корни: Баматов — из тюркского имени Мухаммад, а Бомотов — чисто русское прозвище. При поиске предков стоит учитывать эту вариативность написания в метрических книгах.

Таким образом, фамилия Бомотова — редкий пример, когда прозвище, данное за манеру речи, закрепилось в качестве родового имени. Предки носителей этой фамилии, скорее всего, были крестьянами Русского Севера, а сама фамилия — живое отражение местного говора.