Фамилия Бончужная — редкий случай, когда географическая привязка оказывается важнее разбора корня. Сразу о главном: это украинская фамилия, образованная от прозвища или названия профессии. Основа «бончу́к» в украинском языке (и в южнорусских говорах) означала «палка, дубина, кнут» или «булава» — то есть нечто, чем бьют или управляют. Отсюда прозвище Бончужный могли дать человеку крутого нрава, либо тому, кто ходил с дубиной (пастух, сторож), либо, в более редком значении, «бунтовщику» — от глагола «бончу́ти» (ударить, стукнуть).

Суффикс -н- здесь типичен для украинских фамилий-прилагательных: Бончужный → Бончужная (женская форма). Мужской вариант — Бончужный. Фамилия не дворянская и не искусственная (из семинарий), а народная, прозвищная. Наиболее вероятный ареал — Полтавщина, Черниговщина, Харьковщина, где «бончук» в значении «дубина» фиксируется в диалектных словарях. В центральной России фамилия почти не встречается, что подтверждает её локальный украинский характер.

Интересная деталь: в гетманской Украине XVII–XVIII веков существовала должность «бунчужный» — человек, нёсший бунчук (знак власти гетмана, конский хвост на древке). Но это совсем другое слово (тюркское «бунчук»), и фамилия Бончужная к нему прямого отношения не имеет, хотя внешнее сходство иногда сбивает с толку. В ономастике этот случай — пример того, как народная этимология путает два разных корня: «бончук» (палка) и «бунчук» (знамя). Словарь украинских фамилий (например, работы Ю. Редько) относит такие формы к прозвищным, а не к служебным титулам.

Таким образом, предки носительницы фамилии Бончужная — скорее всего, крестьяне или казаки с Левобережной Украины, получившие прозвище за физическую силу, вспыльчивость или за то, что ходили с дубиной. Фамилия не имеет отношения к знатному роду или канцелярской записи — она бытовая, и в этом её ценность.