Фамилия Боняковская — довольно редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Чтобы разобраться, нужно оттолкнуться от суффикса. Окончание -ская (женский вариант -ский) однозначно указывает на то, что перед нами типичная дворянская или польско-шляхетская фамилия, образованная от названия места. Такие фамилии (Трубецкой, Вяземский, Оболенский) давались по владению землёй или по имени родового поместья. Боняковский, а значит и Боняковская, — это «та, что из Боняково» или «из Боняков».

Географическая привязка здесь — ключ. На картах бывшей Российской империи и Польши можно найти несколько сел и урочищ с названием Боняково. Самое вероятное — деревня Боняково в нынешней Тверской области России. В этом случае фамилия могла закрепиться за помещиками, владевшими этой землей, или за крестьянами, которых переселили оттуда и записали по месту прежнего жительства. Второй вариант — происхождение от польского топонима Boniewo или Bonikowo (Куявско-Поморское воеводство). В польской ономастике фамилии на -ский (-ski) встречаются в десять раз чаще, чем в русской, и почти всегда указывают на шляхетское происхождение.

Корень «Боняк» вызывает споры. Самая прямая версия — от имени собственного Боняк, которое в древнерусском языке могло быть прозвищем. В летописях упоминается половецкий хан Боняк (XI–XII века), известный набегами на Русь. Однако напрямую выводить фамилию от тюркского имени рискованно: слишком много веков разделяет хана и появление фамилий у славян. Куда правдоподобнее, что в основе лежит прозвище Боня — ласкательная или ироничная форма от глагола «бонять» (говорить, болтать, баять) в некоторых южных и западных говорах. Человека, который «бонял» — много и складно говорил, балагурил, — могли прозвать Боней, а его потомки уже получали фамилию по месту жительства или службы.

Ещё один, менее очевидный вариант: фамилия могла возникнуть без географической привязки. В западнорусских землях (современная Беларусь, Украина) существовала модель образования фамилий от прозвища с помощью суффикса -овский/-евский (Боняк → Боняковский). Это характерно для мещан и казаков, которые не владели землёй, но хотели подчеркнуть свой статус фамилией «благородного» образца. В таком случае Боняковская — это жена или дочь Боняковского, чей предок отличался говорливостью или, наоборот, получил прозвище в насмешку.

Итог: носительница фамилии Боняковская, скорее всего, имеет корни в тверских или польских землях, а её предки либо владели деревней Боняково, либо были записаны по месту жительства. Реже — происходят от человека с прозвищем Боня (говорун). Точную версию может подсказать только семейное предание или архивные записи о месте рождения предков.