Фамилия Борганова — женская форма, мужской вариант — Борганов. В её основе лежит прозвище или тюркское имя Борган, и здесь стоит разобраться с двумя возможными источниками, которые не противоречат, а скорее дополняют друг друга.

Первая версия отсылает к тюркскому корню «бор» (мел, известь) или «бор» в значении «серый, бурый». Суффикс «-ган» в тюркских языках часто образует причастия или имена со значением «тот, кто обладает признаком» или «ставший таким». Таким образом, Борган могло означать «сероватый», «белёсый» или быть прозвищем человека со светлыми волосами или сединой. Вторая, не менее вероятная версия, связывает фамилию с тюркским именем Борган, которое восходит к слову «буран» — сильная метель, вьюга. В этом случае имя-оберег давали ребенку, родившемуся в ненастье, или же оно использовалось как пожелание силы и неукротимости характера, подобно стихии.

Фамилия Борганов (и Борганова) характерна для народов Поволжья, особенно для татар и башкир, а также встречается у казахов. Русская фамилия, образованная от прозвища Борган, возможна, но маловероятна — тюркская основа здесь доминирует. Суффикс «-ов» в данном случае не обязательно указывает на русскую адаптацию; у тюркских народов фамилии с этим окончанием массово закрепились в советское время при паспортизации. Раньше носители именовались просто Борган или Борганов сын.

Интересно, что фамилия Борганов встречается и в осетинской среде, где её происхождение может быть связано с местными топонимами или адаптированным тюркским заимствованием. В любом случае, основная линия ведёт к тюркскому прозвищу или имени, которое подчёркивало либо внешний признак (светлый, седой), либо природную силу (буран, метель). Сословная принадлежность предков-носителей могла быть разной: от крестьян до служилых татар, но фамилия не указывает на аристократическое происхождение — это народная модель, типичная для многих семей, получивших фамилии в XIX–XX веках.