Фамилия Босоноговы образована от прозвища Босоногий. Самое прямое значение прилагательного — «необутый, без обуви», «голоногий». В быту так могли назвать нищего, неимущего человека или странника, для которого ходить босиком было вынужденной нормой. Но есть и другая версия, связанная с ремеслом. В некоторых говорах существовало слово «босики» — так называли обувь, сшитую из старых сапожных голенищ, своего рода домашние туфли или легкую рабочую обувь. Если прозвище Босоногий дали сапожнику или торговцу такой обувью, то фамилия хранит память о профессии предка, а не о его бедности.

При образовании фамилии сработала стандартная модель: прозвище на -ий дало основу, к которой добавили патронимический суффикс -ов. Буквальный смысл: «чей?» — «Босоногов», то есть сын, потомок Босоногого. Форма Босоноговы — множественное число, обозначающее весь род.

В ономастике фамилия Босоногов нередко соседствует с однокоренными Босов, Босоногин, Босиков. Все они восходят к одному смысловому гнезду — «босой», «босота», «босиком». Но именно суффикс -огов встречается реже, чем привычные -ов или -ин, что делает фамилию заметной на фоне более типичных русских фамилий.

Точное место возникновения фамилии назвать сложно — прозвище было понятно на всей территории расселения славян, а фамилия могла закрепиться в разных губерниях независимо друг от друга. Чтобы установить конкретную ветвь рода, нужны генеалогические изыскания по документам: ревизским сказкам, метрическим книгам, переписям.