Первая из них восходит к тюркскому слову «бот» (фонетический вариант – «бота»), которое переводится как «верблюжонок». В переносном смысле это слово употреблялось в качестве ласкового прозвища человека с красивыми большими черными глазами. Второй компонент фамилии – «бай» - переводится на русский язык как «богатый хозяин, могущественный человек, господин». По одной из версий, основатель рода Ботбаевых при рождении получил за свои выразительные глаза имя Бота, в компонент «бай» прибавился с целью указать на то, что мальчик является сыном богатого бая. Однако не исключено, что эти два слова использовались в качестве прозвища того, кто обладал очень большими стадами верблюдов. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Ботбаевых можно лишь на основании генеалогических исследований.