Фамилия Ботоев имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Ботоев уходит в XV-XVII вв. Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Ботоев способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Фамилия Ботоев образована от мирского имени Ботой, что в переводе с киргизского означает "верблюжоночек". В Киргизии верблюд считается животным-кормильцем, незаменимым помощником в хозяйстве, а слово "верблюжонок" употребляется по отношению к человеку как ласкательное прозвище. Фамилия Ботоев довольно распространена в юго-восточных регионах России. Эту фамилию носит министр юстиции республики Бурятия Борис Ботоев. Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Ботоев являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Тем не менее, фамилия Ботоев представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.