Фамилия Бованенко — характерный пример украинской фамилии, образованной по продуктивной модели с суффиксом -енко. Этот суффикс, один из самых распространённых на востоке Украины, изначально означал «сын» или «потомок»: Бованенко — буквально «сын Бована». Вопрос в том, что скрывается за основой «Бован».

Самая вероятная версия: в основе лежит прозвище Бован. В украинских говорах слово «бовань» или «бовван» имеет несколько значений: от «болван, чурбан» до «неповоротливый, неуклюжий человек». Встречается оно и в значении «идол, истукан» — так могли назвать кого-то за крупное телосложение или медлительность. Прозвища с таким значением давались не в обиду, а скорее как бытовая характеристика, которая закреплялась за главой семьи и переходила к детям.

Менее распространённая, но не лишённая оснований версия: происхождение от старославянского имени Бован — краткой формы от Богослав или Борислав. В древнерусских памятниках встречается имя Бован, которое могло быть как языческим, так и христианским. Однако в украинской ономастике эта гипотеза уступает прозвищной, поскольку суффикс -енко в массе своей крепился именно к бытовым прозвищам, а не к крестильным именам.

Географически фамилия Бованенко тяготеет к центральным и восточным областям Украины. Наибольшая концентрация носителей — в Черкасской и Полтавской областях, что указывает на историческое ядро фамилии в казацких землях. В дореволюционных метрических книгах Бованенко чаще всего записаны как крестьяне или казаки, без указания на дворянское происхождение.

Словообразовательная модель проста: основа Бован + суффикс -енко. Ударение в фамилии, как правило, падает на третий слог — Бова́ненко, хотя в некоторых диалектах встречается вариант с ударением на второй слог. Письменная форма фамилии устойчива: в отличие от многих украинских фамилий, она не имеет вариантов с чередованием гласных или заменой суффикса.

Для сравнения: однокоренные фамилии — Бованов (русская, с суффиксом -ов), Бованько (с уменьшительным суффиксом) и Бованец (с суффиксом -ец). Все они указывают на одну и ту же основу, но различаются по региону и времени записи. Бованенко — самая «молодая» в этом ряду, возникшая не ранее XVI–XVII веков, когда суффикс -енко стал массово вытеснять другие модели в украинской антропонимии.