Фамилия Бовтушанская — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не ремесло, а географическое название, причём, скорее всего, не славянское. Суффикс -ск- (в женском роде -ская) — верный признак того, что фамилию получили по месту, откуда человек родом. Носительница такой фамилии — потомок того, кого называли «бовтушанец» или «бовтушанский», то есть выходец из населённого пункта с корнем «Бовтуш-».

Главная загадка — где находилось это место. На картах современной России, Украины или Беларуси топоним «Бовтуши» или «Бовтушаны» не прослеживается. Скорее всего, деревня или хутор с таким названием исчезли — могли быть поглощены более крупными селениями, переименованы или просто запустели. Корень «Бовт-» — характерный для западнорусских и украинских говоров. Он восходит к диалектному глаголу «бовтать» — болтать, взбалтывать, а в переносном смысле — говорить бестолково или путано. В украинском языке «бовтати» означает ещё и «мешать» (жидкость), а «бовтун» — болтун, пустомеля. На этом основании можно предположить, что прозвище Бовтуш — «болтун» или «непоседа» — дали человеку, а уже от него образовали название поселения, жители которого стали Бовтушанскими.

Однако более правдоподобна версия, что фамилия сохранила память о микротопониме. В XIX веке на территории Подольской или Волынской губерний мог существовать фольварк или урочище Бовтуши. Фамилии на -ский/-цкий в этих краях часто получали не крестьяне, а мелкая шляхта или духовенство — то есть люди, чей статус требовал привязки к земле. Поэтому Бовтушанская — фамилия шляхетского или однодворческого происхождения, хотя со временем она могла распространиться и среди крестьян, переселившихся из того же имения.

Необычность фамилии ещё и в том, что она почти не встречается за пределами бывшей черты оседлости. Это указывает на узкую локальную традицию: вероятно, все Бовтушанские — выходцы из одного небольшого гнезда, которое не дало массового расселения. В отличие от распространённых Ивановых или Кузнецовых, эта фамилия — точный маркер конкретного места, которое сегодня можно найти разве что в архивных ревизских сказках.