Фамилия Боюккишиева — наглядный пример того, как русский суффикс «накладывается» на иноязычную основу, образуя фамилию по привычной восточнославянской модели. Перед нами женская форма, мужской вариант — Боюккишиев. В основе лежит тюркское составное имя или прозвище. Первая часть, «боюк» (büyük), в тюркских языках означает «большой, великий, старший». Вторая часть — «киши» (kişi) — переводится как «человек, мужчина». Таким образом, Боюккиши — это «большой человек» или «старший мужчина», то есть уважаемый, влиятельный человек, возможно, глава рода, старейшина или крупный землевладелец.

Словообразовательная модель фамилии проста: к основе Боюккиши добавлен русский патронимический суффикс -ев (в мужском варианте) и окончание -а (в женском). Такое оформление типично для фамилий, которые возникли у народов Кавказа, Закавказья и Средней Азии в период вхождения их территорий в состав Российской империи. Фамилии на -ев/-ов у тюркских народов часто фиксировались при переписях и в документах как русифицированная форма отчества или родового прозвища.

Географически фамилия Боюккишиева, скорее всего, имеет азербайджанские или турецкие корни. В Азербайджане имя Боюккиши встречается как личное имя, а фамилии на -ев/-ова там распространены повсеместно. Встречается она и среди народов Дагестана, особенно у кумыков и лезгин, где также сильны тюркские языковые влияния. В Турции, где нет суффикса -ев, аналогом была бы фамилия Бююккиши (Büyükkişi) или просто Бююк.

Интересно, что фамилия сохранила архаичное, «книжное» звучание: слово «киши» в современном разговорном азербайджанском чаще заменяется на «адам» (человек) или «оглан» (парень), тогда как «киши» осталось в более формальном или поэтическом употреблении. Это косвенно указывает на то, что прозвище могло быть дано не в бытовой речи, а как официальное или почётное именование. Вероятно, предок носителя фамилии был заметной фигурой в своей общине — не обязательно знатного рода, но человека, чьё слово имело вес.