Фамилия Бубинас — редкая и примечательная тем, что её окончание -ас нехарактерно для исконно русских фамилий. В русской ономастике суффиксы -ас, -ис, -ус почти всегда указывают на литовское или жемайтийское происхождение. Бубинас — это литовская фамилия, образованная по продуктивной модели: основа + суффикс -inas (в русской передаче -инас). Такие фамилии в Литве носят характер притяжательных прилагательных и отвечают на вопрос «чей?»: Бубинас — «принадлежащий Бубе».

Основа Буба (лит. Būba, Bubà) в литовском языке — это либо прозвище, связанное с диалектным словом būba («толстяк», «увалень»), либо детское звукоподражательное имя, которое давали младенцам (ср. русское «баю-бай»). Есть и вторая версия: в литовских говорах buba — «шишка», «нарост», так могли прозвать человека с заметной родинкой или выпуклостью на лице. Таким образом, родоначальник Бубинасов, скорее всего, жил на территории исторической Литвы (включая современную Литву и западную Беларусь) и получил прозвище по внешности или поведению.

В отличие от русских фамилий на -ов/-ин, литовские фамилии на -инас не склоняются по падежам в русском языке (Бубинас, Бубинасу, Бубинасом), и это часто путает носителей. В Литве фамилия Бубинас встречается нечасто, но известна в этнографических регионах Аукштайтии и Сувалкии. Если ваш предок носил эту фамилию в Российской империи, он, вероятно, был литовцем или белорусом-католиком, а сама фамилия могла писаться через «ы» — Бубынас, что отражает разницу в произношении. В современной России Бубинасы — единичные семьи, и их история почти всегда ведёт к миграциям конца XIX — начала XX века из западных губерний.