Фамилия Буинцев образована по русской модели с суффиксом -ев, который присоединяется к основе, оканчивающейся на -ц. Это указывает на то, что предок носителя фамилии носил прозвище или патроним Буинец, от которого и пошёл род. Суффикс -ев в фамилиях характерен для территорий, где цокали или где имя-основа заканчивалась на твёрдый согласный, перешедший в ц.

Корень фамилии — «буин-» — вызывает несколько версий происхождения, и самая вероятная связана с древнерусским словом «буй» или «буйный». В старорусском языке «буй» означало не только «смелый, отчаянный», но и «дикий, необузданный». Прозвище Буй мог получить человек с крутым нравом, забияка или, напротив, тот, кто жил на «буевище» — открытом возвышенном месте, кладбище или пустоши, где проводили народные собрания. В этом случае Буинец — это человек, связанный с таким местом или получивший прозвище от отца-Буя.

Менее распространённая, но возможная версия — топонимическая. В России есть несколько населённых пунктов с названием Буинск, самое известное — город в Татарстане, а также село Буино в Курской области. Житель такого места назывался буинец, то есть «выходец из Буинска». Фамилия Буинцев могла закрепиться за переселенцами, которые переехали из этих мест и получили прозвище по месту прежнего жительства.

Словообразовательно фамилия Буинцев стоит в одном ряду с такими фамилиями, как Козинцев, Хованцев, Зуевцев. Все они образованы от прозвищ или названий на -ец через притяжательный суффикс -ев. Это относительно редкая модель, что делает фамилию Буинцев нетипичной для массовых крестьянских фамилий центральной России, где чаще встречались фамилии на -ов и -ин. Скорее всего, предки Буинцевых были либо выходцами из южных или восточных регионов, где цоканье было распространено, либо принадлежали к служилому сословию, где прозвища фиксировались в документах именно в такой форме.

Встречаемость фамилии невысокая, что подтверждает её локальный характер. Основные очаги фамилии — Поволжье и южные области России, что косвенно поддерживает версию о связи с Буинском или буйными землями.