Фамилия Бухинная — один из тех редких случаев, когда окончание «-ая» не указывает на женский род, а входит в основу фамилии. Это не вариант фамилии Бухин (который склонялся бы как мужская фамилия на -ин), а самостоятельная форма, образованная по модели прилагательного. Такие фамилии в русской традиции чаще всего принадлежали духовенству или формировались на основе прозвищ с суффиксом -н(ой).

Основа фамилии — «бухин-». Самое вероятное объяснение: прозвище Буха, от которого через притяжательное прилагательное «бухин» (сын или человек Бухи) и возникла фамилия. Слово «буха» в русских говорах имело несколько значений. В северных и сибирских диалектах «бухой» означало «глухой» или «тугой на ухо». В других областях «буха» — это неуклюжий, медлительный человек, иногда — тот, кто «бухает», то есть издаёт глухие звуки, стучит. Не исключено, что прозвище дали человеку с низким, гулким голосом или тяжёлой походкой.

Менее вероятна, но возможна связь с глаголом «бухать» в значении «пить много хмельного» — в этом случае прозвище носило бы ироничный или предупредительный характер. Однако в основе фамилий чаще лежат нейтральные или описательные признаки, а не явно пейоративные.

Суффикс -ин- в основе указывает на принадлежность: Бухинная буквально — «жена или вдова Бухи» (если фамилия женская) или «относящийся к Бухе» (если фамилия мужская, как форма прилагательного). В документах XVIII–XIX веков такие формы встречались у однодворцев и крестьян южнорусских губерний, а также в среде духовенства, где фамилии часто давали по прозвищам с окончанием -ский/-ой/-ая.

Географически фамилия редкая. Её локальные очаги можно предположить в Курской, Орловской, Воронежской областях — там, где диалектное слово «буха» было в ходу. Встречается она и у старообрядцев, которые дольше сохраняли архаичные модели фамилий.

Однокоренные фамилии — Бухин, Бухов, Буханов — образованы от той же основы, но по более распространённым моделям на -ин и -ов. Бухинная — вариант, который сохранил редкую грамматическую конструкцию, что делает её особенно ценной для историков языка.