Фамилия Буныгин — редкий пример, где основа, скорее всего, не русская, а тюркская, но оформленная по русской словообразовательной модели. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Буныгин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Буныга. Но что такое «Буныга»?

Здесь и начинается главная сложность. В древнерусских говорах слово «буня» или «буныга» не зафиксировано в словарях как распространённое прозвище. Самая вероятная версия выводит фамилию из тюркских языков. В татарском, башкирском и других тюркских наречиях существует корень «бун» (бун, бунлы) со значением «тоска», «печаль», «тревога» или «смута». Прозвище Буныга могли дать человеку угрюмому, тревожному, либо — по контрасту — тому, кто постоянно попадал в беспокойные истории. В русской среде это прозвище «обрусело»: тюркский корень получил фамильный суффикс -ин, и так возникла фамилия Буныгин.

Альтернативная версия связывает фамилию с диалектным словом «буня» — так в некоторых областях (например, в рязанских и тамбовских говорах) называли ворчуна, брюзгу. Тогда Буныга — тот же ворчун, и фамилия имеет чисто славянскую природу, но эта версия менее убедительна, так как слово «буня» в значении «ворчун» — локальное и редкое, а фамилия Буныгин встречается не только в тех краях.

География фамилии подсказывает её возможное происхождение. Буныгины чаще всего встречаются в Поволжье — в Нижегородской, Самарской, Ульяновской областях, а также в Татарстане. Это зона активных русско-тюркских контактов, где фамилии с тюркской основой и русским окончанием — обычное дело. Предки Буныгиных могли быть крещёными татарами, чувашами или мордвой, либо русскими, перенявшими прозвище от соседей-тюрков.

Интересно, что фамилия не имеет «двойников» с другим суффиксом (Буныгов, Буныгинский) — это говорит о том, что она возникла в одной конкретной местности и не распалась на варианты. По сословной принадлежности Буныгины, скорее всего, были крестьянами или мещанами, так как в дворянских родословных книгах фамилия не значится.