Фамилия Бушура — одна из тех, где на первый план выходит не суффикс, а сама основа, звучащая как прозвище. В русской ономастике модель фамилий без типичных окончаний (-ов, -ин, -ский) встречается реже, и Бушура — как раз такой случай: это «островная» фамилия, застывшая в форме чистого прозвища или имени. Скорее всего, её корень — в южнорусских или украинских говорах, где слово «бушура» могло означать нечто шумное, буйное или неряшливое. В словаре В. И. Даля зафиксировано слово «бушура» в значении «неопрятная женщина, растрепа», а также глагол «бушевать» — буянить, шуметь. Таким образом, прозвище Бушура могли дать человеку с беспокойным, взрывным характером либо тому, кто не следил за внешностью.

Вторая версия, менее распространённая, но тоже имеющая право на существование, — связь с украинским «бушура» (разруха, беспорядок) или с диалектным «бушур» (вид рыбы, например, ерш). Если предок промышлял рыболовством, прозвище могло закрепиться за ним по роду занятий. Однако первая гипотеза — от прозвища по характеру — выглядит убедительнее: фамилия Бушура органично ложится в ряд таких же «характерных» фамилий без суффиксов, как Несмеяна, Молчун или Буян.

Географически фамилия тяготеет к югу России и востоку Украины. В переписях XIX века Бушуры встречаются в Курской, Воронежской губерниях, а также в казачьих областях — на Дону и Кубани. Казачья среда, с её склонностью к метким прозвищам, могла легко породить такую фамилию. Интересно, что ударение в ней плавающее: в одних родах говорят «Бушура́», в других — «Бу́шура», что указывает на разное происхождение: от глагола «бушевать» (с ударением на последний слог) или от существительного «бушура» (с ударением на первый).

Сравнение с однокоренными фамилиями — Бушуев, Бушуй — показывает, что Бушура стоит особняком. Бушуев образован через типичный суффикс принадлежности, указывая на потомка Бушуя. Бушура же сохранила архаичную форму, что может говорить о более раннем закреплении прозвища или о влиянии украинской традиции, где фамилии на -а (Шевченко, Гончаренко) распространены шире. Так или иначе, фамилия Бушура — яркий пример того, как одно слово может нести в себе и портрет предка, и историю его диалекта.