Фамилия Чаптарова происходит от древнейшей формы прозвищ, образованных от географического названия местности, выходцем из которой являлся один из предков. Фамилия Чаптарова восходит к гидрониму Чаптар. Небольшая река Чаптар с каменистыми склонами без растительности протекает на территории Алтайского края. Возможно, основатель рода Чаптаровых был выходцем с берегов этой реки. Название Чаптар восходит к татарскому слову «чаптыру» - «бить струей». Вероятно, когда-то река Чаптар отличалась бурным, неспокойным течением.