Фамилия Черепякина — женская форма от Черепякин, и её происхождение напрямую связано с русским словом «череп». Но не спешите представлять мрачные образы: в основе фамилии лежит не анатомия, а вполне бытовое прозвище, которое могло относиться к гончарному ремеслу. В старину «черепком» называли глиняный черепок, осколок посуды, а «черепяник» или «черепяка» — это тот, кто делал глиняную посуду, то есть горшечник или гончар. Такое прозвище закреплялось за мастером, и со временем перешло в фамилию.

Суффикс -ин в форме Черепякин указывает на принадлежность: «чей?» — сын Черепяки, то есть потомок гончара. Модель образования типична для русских фамилий, особенно в северных и центральных регионах, где прозвища на -а, -я активно давали начало фамилиям на -ин. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще образовывались от имен или прозвищ на твердый согласный, форма на -ин подчеркивает, что исходное прозвище звучало как Черепяка.

Встречается и альтернативная версия: связь с диалектным словом «череп» в значении «крутой обрыв», «холм» или «скала». В таком случае прозвище Черепяка могли дать человеку, жившему на возвышенности или у обрыва. Однако эта гипотеза менее убедительна: гончарное ремесло было распространено повсеместно, и именно оно дало жизнь целому ряду фамилий — Черепков, Черепанов, Черепенников. Черепякина стоит в одном ряду с ними, но с характерным мягким произношением, которое могло закрепиться в местных говорах.

Географически фамилия редкая, её можно встретить в Поволжье и некоторых областях Центральной России, но массового распространения она не получила. Это говорит о том, что носители, вероятно, происходят из одной или нескольких локальных ветвей, связанных с конкретным гончарным промыслом. В дореволюционных записях Черепякины могли быть ремесленниками или крестьянами, а сама фамилия сохранила память о труде предков, которые работали с глиной и огнем, превращая обычный черепок в нужную в быту вещь.