Фамилия Черепягина — женская форма фамилии Черепягин, и её разбор стоит начать с неочевидного: с суффикса -яг-. В русской ономастике это довольно редкий словообразовательный элемент. Чаще встречаются -аг- (как в Воробьёв или Корягин), а -яг- — вариант, который обычно указывает на прозвище, образованное по модели прилагательного или существительного с экспрессивной, уменьшительной или уничижительной окраской. Похожая модель — фамилии Бодягин, Кудрягин, Рябягин. То есть основа Черепяг- — это не прямое название предмета, а скорее прозвище человека, которого за что-то так назвали.

Корень, очевидно, — череп. Но не спешите думать о костях головы. В древнерусском языке и говорах «череп» имел несколько значений: черепок, обломок глиняной посуды, а также верхняя часть печи, свод. В северных и центральных говорах «черепяга» или «черепяка» — это глиняный горшок, миска, черепок битой посуды. Так могли прозвать гончара, торговца посудой или просто неряшливого человека, который всё бьёт. Есть и другая версия: в некоторых диалектах «черепягой» называли человека с крупной, заметной головой или с лысиной (как черепок — гладкий). Но первое значение, связанное с глиняной утварью, выглядит убедительнее: оно конкретнее и чаще встречается в источниках по прозвищам ремесленников.

Географически фамилия Черепягин довольно редкая, но имеет отчётливый «след» в центральной России и Поволжье. Встречается в архивных записях по Тверской, Костромской и Нижегородской губерниям — именно в тех краях, где гончарный промысел был традиционным. В XIX веке Черепягины нередко числились среди крестьян и мещан, реже — среди купцов (что логично, если предки торговали горшками). Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано — это «народная» фамилия, возникшая в среде ремесленников или крестьян.

Сравнение с однокоренными фамилиями даёт дополнительную ясность. Черепанов — от «черепан» (гончар), Черепков — от «черепок». Черепягин стоит в том же ряду, но с другим суффиксом. Если Черепановых много по всей России, то Черепягиных заметно меньше — это более локальный вариант прозвища, возможно, закрепившийся в одной местности. В говорах слово «черепяга» могло звучать иронично или ласково, но в основе всё равно лежало указание на профессию или характерную черту внешности.

Итог простой: предки носительницы фамилии Черепягина с большой вероятностью были гончарами, либо их прозвали за сходство с горшком или черепком. Фамилия не выдуманная и не книжная — она родилась в живой речи, в мастерской или на базаре, где битая посуда была обычным делом.