Фамилия Чиголя — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Самое логичное объяснение: она образована от прозвища, связанного с диалектным словом. В южнорусских и украинских говорах «чиголь» или «чиголя» могли называть человека невысокого роста, юркого или суетливого — слово звукоподражательное, напоминающее чириканье или быстрый щебет. Есть и вторая версия: в некоторых областях «чиголь» — это название птицы, например чижа или овсянки. Тогда прозвище могли дать человеку с птичьей внешностью, голосом или повадками.

Словообразовательная модель проста: основа «чигол-» плюс окончание «-я». Такие фамилии на «-я» характерны для украинской и белорусской традиции (сравните: Чиголя, Скрипля, Мельголя). Они часто фиксировались без дополнительного суффинса, прямо из прозвища в именительном падеже. Это отличает Чиголю от более частых русских фамилий на «-ов» или «-ин» — здесь мы видим юго-западный след.

Географически фамилия тяготеет к Черниговской, Полтавской и Курской губерниям — регионам, где пересекались украинское и южновеликорусское население. Встречается она и сейчас преимущественно на западе России и востоке Украины, но крайне редко. По сословной принадлежности предки Чиголи, скорее всего, были крестьянами или мещанами — прозвища такого типа редко давали дворянам.

Спорных версий немного: иногда пытаются связать Чиголю с тюркским «чигиль» (название древнего племени), но это натяжка — слово не оставило следов в славянском быту. Намного правдоподобнее объяснение через птицу или звукоподражание: оно ближе к живой речи, из которой и выросла фамилия.