Фамилия Чихера — редкая и неочевидная по происхождению. Сразу бросается в глаза, что она не вписывается в стандартную модель русских фамилий на -ов, -ев или -ин. Суффикс -а указывает на то, что перед нами, скорее всего, не патроним (не «чей-то сын»), а застывшая форма прозвища или существительного в именительном падеже. Такие фамилии характерны для украинской, белорусской, а также южнорусской ономастики, где окончание -а нередко сохранялось в фамилиях без дополнительного суффикса.

Наиболее вероятная основа — слово «чихирь». В южнорусских говорах и украинском языке «чихирь» означает кислое, обычно домашнее вино, а также слабый алкогольный напиток вроде браги или самогона. Прозвище Чихера могли дать либо любителю выпить, либо виноделу, либо человеку, торговавшему таким пойлом. В пользу этой версии говорит и то, что корень «чих-» в славянских языках часто связан с шипением, брожением и алкоголем (ср. «чихирь», «чирка» — вид водки). Менее убедительна версия о связи с глаголом «чихать»: хотя фамилии от физических действий встречаются (например, Хрипун, Пердунов), форма «Чихера» для этого нехарактерна — скорее было бы «Чихун» или «Чихалов».

Географически фамилия тяготеет к западу и югу России, а также к Украине. Встречается она крайне редко, что говорит о локальном бытовании прозвища. В дореволюционных источниках по Слобожанщине и Черниговщине можно найти единичные упоминания людей с такой фамилией, что подтверждает её украинско-белорусский след. Сословной принадлежности предков по одной фамилии не определить — Чихеры могли быть и крестьянами, и мещанами, но маловероятно, что дворянами: фамилия не имеет характерных «дворянских» суффиксов вроде -ский.

Если сравнивать с однокоренными, то ближайшая аналогия — фамилия Чихирев (от того же «чихирь»), которая встречается чаще и тоже говорит о связи с виноделием или прозвищем пьяницы. Чихера же — более редкий вариант, где прозвище не обросло патронимическим суффиксом, а перешло в фамилию в чистом виде. Это делает её особенно интересной для этимолога: перед нами не «фамилия сына Чихеры», а, возможно, фамилия самого Чихеры — человека, которого так прозвали при жизни.