Фамилия Чикушкин — редкий пример, где суффикс -ин не указывает на прямое отчество от отца, а скорее на прозвище или профессию предка. Основа «Чикушк-» образована от слова «чикуша» или «чикушка» — так в русских говорах, особенно в северных и сибирских регионах, называли мелкую птицу, обычно кулика или чибиса. В переносном смысле «чикушей» могли прозвать невысокого, юркого человека, а иногда — болтливого или суетливого, по ассоциации с птичьей подвижностью.

Суффикс -к- в основе (Чикуш-к-а) типичен для уменьшительно-ласкательных или пренебрежительных форм личных имён и прозвищ в XVI–XVII веках. Затем к этому прозвищу прибавили притяжательный суффикс -ин, обозначающий «сын Чикушки» или «родом из семьи Чикушек». Таким образом, Чикушкин — это «сын того, кого звали Чикушка». Модель образования фамилии характерна для крестьянской и посадской среды: она недворянская, без суффикса -ский, что указывает на простое происхождение.

Географически фамилия Чикушкин встречается редко, но её следы прослеживаются в Вологодской и Архангельской областях, а также в Поволжье. Это косвенно подтверждает связь с северорусскими говорами, где слово «чикуша» действительно бытовало. В центральных и южных регионах России фамилия почти не фиксируется. Интересно, что в некоторых диалектах «чикушей» называли также деревянный молоток или киянку — инструмент бондарей и плотников. Если предок был ремесленником, прозвище могло перейти на него по инструменту, но птичья версия всё же правдоподобнее: прозвища от названий птиц давали чаще, чем от названий орудий труда.

В отличие от распространённых фамилий на -ов/-ев, Чикушкин сохранил редкую основу, не вытесненную литературной нормой. Это делает фамилию ценной для историков говоров: по ней можно реконструировать локальное слово, не попавшее в словари литературного языка. В официальных документах XIX века форма «Чикушкин» закрепилась без вариантов, хотя в быту могли писать «Чикушкын» или «Чикушкинъ» — до реформы орфографии 1918 года.