Фамилия Чингисханова — редчайший случай в русском ономастиконе. Она не образована от крестильного имени, прозвища по ремеслу или внешности, а напрямую выводится от титула и имени основателя Монгольской империи — Чингисхана. В русской традиции фамилии на -ов/-ев от восточных имён и титулов встречаются (например, Султанов, Ханов), но прямая отсылка к Чингисхану — исключение, а не правило.

Разбор словообразовательной модели прост: основа «Чингисхан» + патронимический суффикс -ов- + окончание -а (женская форма). Мужской вариант — Чингисханов. Суффикс -ов указывает на принадлежность: буквально «чей?» — Чингисханов, то есть потомок или человек из рода Чингисхана. Однако носитель фамилии не обязательно прямой наследник великого хана. Чаще всего такие фамилии давали в среде татарской, башкирской, казахской знати, которая вела родословную от Чингизидов — потомков Чингисхана по мужской линии. В Российской империи некоторые княжеские роды (например, Чингисхановы из числа касимовских татар) официально носили эту фамилию, подчёркивая своё происхождение.

Сложность в том, что фамилия могла возникнуть и в XX веке как искусственная — в советское время, при смене паспортов, некоторые люди брали фамилии по историческим деятелям. Но для фамилии Чингисханова более правдоподобна первая версия: она указывает на принадлежность к сословию Чингизидов, которые даже после падения ханств сохраняли социальный статус вплоть до XIX века. В документах встречаются записи о «князьях Чингисхановых» в Оренбургской и Астраханской губерниях.

Географически фамилия тяготеет к Поволжью и Приуралью — регионам, где жили татарские и башкирские аристократические роды. В современной России она остаётся очень редкой, чаще встречается в Татарстане и Башкортостане. Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Чингисха́нова.

Однокоренные фамилии — Ханов, Султанов, Гиреев — образованы по той же модели, но Чингисханова стоит особняком: она не просто от титула, а от имени-титула, ставшего символом целой эпохи. Носитель этой фамилии с высокой вероятностью происходит из рода, который в прошлом помнил свою связь с верховной властью.