Фамилия Чирушкина — женская форма фамилии Чирушкин, и её разбор стоит начать не с корня, а с суффикса. Суффикс -к- в основе «Чирушк-» указывает на то, что прозвище или имя, от которого образована фамилия, имело уменьшительно-ласкательную или обиходную форму. Фамилии на -ин (-ын), как и Чирушкин, традиционно образовывались от имён или прозвищ, оканчивающихся на -а/-я: Чирушка → Чирушкин. Это говорит о том, что предок носителя фамилии, скорее всего, был известен в своей среде как Чирушка — не по паспорту, а по бытовому прозвищу.

Корень «чир-» в русских говорах многозначен. Самое вероятное объяснение — связь с диалектным словом «чир» или «чирок», которым в разных регионах называли небольшую утку (чирка) или, реже, мелкую рыбёшку. В ономастике такие фамилии по птицам и животным — одни из самых распространённых, и Чирушкина в этом ряду стоит рядом с фамилиями Чириков, Чирков, Чирухин. Прозвище Чирушка могли дать человеку невысокого роста, юркому или обладателю пронзительного голоса — по аналогии с чирканьем утки.

Менее распространённая, но возможная версия — происхождение от личного имени Чир. В дохристианской Руси существовало имя Чир, которое, по мнению некоторых исследователей, могло быть сокращением от славянских имён с корнем «чир-» (например, Чирослав), но документальных подтверждений этому мало. Словарь древнерусских имён С. Б. Веселовского упоминает прозвище Чир в значении «птенец» или «малыш», что снова возвращает нас к уменьшительному значению.

Географически фамилия Чирушкин (и Чирушкина) встречается не повсеместно. Наибольшая концентрация носителей зафиксирована в центральных областях России — в Тверской, Псковской и Новгородской губерниях, где были сильны диалектные формы «чирок» и «чируха». Это косвенно подтверждает версию о птичьем прозвище: в этих краях охота на чирков была обычным промыслом.

Сословная принадлежность предков Чирушкиных, скорее всего, крестьянская или мещанская. Фамилия не относится к дворянским и не упоминается в родословных книгах; её модель образования — типично крестьянская, через прозвище и суффикс принадлежности. Никаких знаменитых носителей фамилии в истории не зафиксировано, что для массовых русских фамилий — обычное дело.