Фамилия Чистоблинникова — редкий случай, когда прозвище или профессия предка читается почти буквально. В основе лежит слово «блинник» — так в русских говорах называли того, кто печёт блины, либо любителя их поесть. Первая часть «чисто-» может указывать либо на качество работы (чисто, аккуратно делает блины), либо на чистоту продукта (блины из чистой муки, без примесей). Но есть и другая, бытовая версия: «чистоблинником» в шутку могли прозвать человека, который съедал всё подчистую, особенно блины, или же, наоборот, того, кто пёк такие тонкие и ровные блины, что они казались «чистыми» — прозрачными.

Суффикс -ов- (в мужском варианте Чистоблинников) указывает на принадлежность: сын Чистоблинника. Женская форма Чистоблинникова — это либо жена, либо дочь. Фамилия образована по продуктивной модели от прозвища, а не от имени, и это говорит о том, что предок был известен именно своим занятием или характерной чертой. В отличие от фамилий на -ский, которые часто давались по географическим названиям, Чистоблинникова — «ремесленная» или «прозвищная», что типично для крестьянской и мещанской среды центральной России и Поволжья.

С точки зрения ономастики, это составное прозвище с определением и существительным — архаичный, но живой тип, который встречается в фамилиях вроде Добронравов или Белоруков. Однако «блинник» — слово конкретное, бытовое, поэтому фамилия могла возникнуть в среде, где выпечка блинов была заметным промыслом: на ярмарках, в трактирах или в больших крестьянских семьях, где пекли блины на Масленицу и по праздникам.

Встречается фамилия преимущественно на юге России и в Сибири, куда переселенцы принесли её в XIX веке. Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Чистобли́нникова, хотя в устной речи возможны варианты. Фамилия не принадлежала дворянским родам — её носители были крестьянами или мещанами, что подтверждается отсутствием в «Бархатной книге» и других родословных сборниках. Сегодня это одна из тех редких, но прозрачных фамилий, где профессия или прозвище предка не требует долгих разысканий: достаточно вспомнить, что такое блин и что значит «чисто» в старом бытовом смысле.