Фамилия Чижинцев — одна из тех, что построена по редкой словообразовательной модели. Если большинство русских фамилий на -ов/-ев или -ин образованы напрямую от имени или прозвища отца (Иван → Иванов, Чиж → Чижов), то здесь мы видим цепочку: сначала от прозвища Чиж образовали притяжательное прилагательное «чижин» (буквально «чижиный»), а уже от него — отчество-фамилию Чижинцев. Такой суффикс -инцев (а в женском варианте -инцева) характерен для южнорусских и украинских говоров, где фамилии нередко фиксировали принадлежность к роду через форму «чей будешь?» — «Чижинцев», то есть «внук или потомок Чижина».

Основа фамилии — прозвище Чиж. На Руси птичьи прозвища давали по внешности (небольшой, подвижный человек), по характеру (задиристый, как чиж в стайке) или по занятию. Чижами могли называть птицеловов, а также людей, торговавших певчими птицами, — промысел был распространён в центральных и южных губерниях. В отличие от более частых Чижовых или Чижиков, фамилия Чижинцев чётко указывает на второй шаг в именовании: первого предка звали Чиж, его сына — Чижин (то есть «Чижов сын»), а внук уже получил фамилию Чижинцев. Такая трёхступенчатая модель встречается реже и говорит о том, что фамилия сложилась не в среде крестьян, а скорее в среде служилых или посадских людей, где родовые прозвания фиксировались раньше и точнее.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где суффикс -инцев был активен: это Курская, Воронежская, Тамбовская губернии, а также земли бывшей Слобожанщины. Встречается она нечасто — Чижинцевых заметно меньше, чем Чижовых, и это делает её хорошим маркером для генеалогического поиска: если вы носите эту фамилию, с высокой вероятностью ваши предки происходят из чернозёмной полосы России или с востока Украины. Однокоренные варианты — Чижин, Чижинский — могут указывать на ту же основу, но с разной географией: Чижинский чаще встречается у поляков и белорусов.

Ударение в фамилии, судя по живой речи носителей, падает на второй слог: Чижи́нцев. В дореволюционных документах встречается написание через «ы» — Чижынцев, что отражает местное аканье или диалектное произношение. Никаких дворянских гербов или знаменитых родов за этой фамилией не числится — это типичная фамилия-отчество, которая просто и точно говорит о том, что основатель рода носил птичье прозвище.