Фамилия Чижунас — редкий для русского уха случай, который сразу выдает её литовское или польско-литовское происхождение. Она образована по типичной для литовской ономастики модели: основа + суффикс -унас (-ūnas). Этот суффикс в литовском языке часто указывает на принадлежность или происхождение, примерно как русское «-ов/ев» или «-ин». То есть Чижунас буквально означает «сын Чижа» или «человек из рода Чижа».

Корень здесь — Чиж, и это, скорее всего, не птица, а прозвище. В славянских языках «чижом» могли назвать невысокого, вертлявого или небогатого человека, а в литовском языке есть слово čyžas (или čyžius) — так называли арендатора, съемщика земли. Это прозвище было распространено среди крестьян и мелкой шляхты на территории Великого княжества Литовского, где литовский и славянские языки переплетались веками.

Судя по окончанию, фамилия не прошла через русскую грамматику — она не получила типичных славянских суффиксов -ов или -ин. Это значит, что её носители, вероятно, оставались в среде, где литовские фамилии сохраняли оригинальную форму: в Жемайтии, Аукштайтии или на приграничных землях современной Беларуси. Встречаются варианты написания: Чижунас, Čižiūnas, а также полонизированные формы вроде Чижун.

С социальной точки зрения, предки Чижунасов, скорее всего, были либо крестьянами-арендаторами, либо мелкими землевладельцами, которых называли «чижами». Фамилия не дворянская, но и не редкая для литовского простонародья. Если ваш предок носил её в XIX веке, он почти наверняка жил в Ковенской или Виленской губернии.

Сегодня фамилия Чижунас встречается в Литве и среди литовской диаспоры, а в России — единично, обычно у потомков переселенцев из западных губерний.