Фамилия Чмутенко звучит на украинский лад: суффикс -енко указывает на происхождение с территории современной Украины, где такие фамилии в XVI–XVII веках закрепились за казаками и крестьянами. В буквальном смысле -енко означает «сын» или «потомок», то есть Чмутенко — это «сын Чмута» или «потомок человека по прозвищу Чмут».

Основа фамилии — прозвище Чмут. В украинских и южнорусских говорах «чмут» означало человека несерьёзного, пустого, хвастливого или ненадёжного. В словаре Владимира Даля «чмут» — это «плут, мошенник, обманщик», а также «хвастун». Впрочем, в диалектах встречалось и более мягкое значение: чудак, балагур, тот, кто морочит голову. Скорее всего, прозвище дали человеку с весёлым, но непостоянным нравом — не злодею, а скорее шутнику или болтуну.

Есть и вторая, менее вероятная версия: от глагола «чмутить» — мутить, смущать, вводить в заблуждение. В этом случае Чмут — тот, кто мутит воду, сеет смуту. Но ономастика чаще связывает такие прозвища с бытовой характеристикой, а не с социально-политическим контекстом.

Географически фамилия Чмутенко встречается в основном на востоке Украины и в приграничных областях России — в Сумской, Харьковской, Белгородской областях. В XIX веке носители фамилии записывались в ревизских сказках как государственные крестьяне и казаки. Сословной элиты среди Чмутенко не было — это фамилия простых людей, чьи предки получили прозвище за характер или поведение.

По модели образования фамилия Чмутенко — типичный украинский патроним: к основе Чмут- добавили суффикс -енко, который позже застыл в форме фамилии. В русском языке аналогичные фамилии (Чмутов, Чмутин) встречаются реже, так как суффикс -ов/-ин там был основным. Чмутенко — яркий пример того, как региональная традиция словообразования сохранила память о прозвище предка.