Фамилия Чмырдяйкин звучит настолько необычно, что сразу вызывает желание разобраться в её корнях. Она образована по очень распространённой в русской ономастике модели: к основе, в данном случае прозвищной, добавился суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — Чмырдяйкин, то есть сын или потомок Чмырдяйки). Финальное -к- в основе — это уменьшительный суффикс, который в прозвищах часто придаёт оттенок ироничной ласки или фамильярности.

Главная загадка — в корне «чмырд-». Скорее всего, он восходит к диалектному слову «чмырдь» или «чмырда». В рязанских и тамбовских говорах так могли называть неопрятного, неряшливого человека, замухрышку. В других говорах слово «чмырить» означало «чахнуть, болеть, быть в унынии». Таким образом, прозвище Чмырдяй (а от него — Чмырдяйка) мог получить либо человек, который плохо выглядел и одевался, либо тот, кто постоянно ходил хмурым и болезненным.

Менее вероятна, но не исключена версия, что в основе лежит тюркское или финно-угорское слово, переосмысленное на русской почве. Однако звуковой облик «чмырд» — типично русский, с характерным для экспрессивной лексики сочетанием согласных. Судя по суффиксу -ин, фамилия закрепилась в среде, где на вопрос «чей ты?» отвечали «Чмырдяйкин сын» — то есть в крестьянской или мещанской среде центральной России.

Географически фамилия редкая, её очаги, вероятно, находятся в Поволжье или Черноземье. Сравните с однокоренными фамилиями Чмырёв, Чмырин, Чмыркин — все они образованы от одного и того же корня, но с разными суффиксами. Чмырдяйкин выделяется своей «растянутой» и почти сказочной формой, что делает её одной из самых запоминающихся русских фамилий.