Фамилия Чоборяк — редкий случай, когда исходное слово почти не изменилось, а суффикс указывает на конкретную этническую и социальную среду. Основа здесь — «чобор», украинский и южнорусский диалектный вариант слова «чебрец» (чабрец, богородская трава). В говорах западных и центральных областей Украины «чобором» называли не только само растение, но и его резкий, терпкий запах. Прозвище Чобор мог получить либо травник, знахарь, собиравший и продававший чабрец, либо человек, от которого пахло этой травой (например, живший рядом с зарослями или сушивший её в избе).

Суффикс -як — один из характерных показателей украинской антропонимии, часто указывающий на принадлежность к какой-либо местности, роду занятий или на носителя яркого признака. В данном случае он оформляет прозвище в фамилию: Чоборяк — «сын Чобора» или «человек, связанный с чобором». Такая модель типична для Подолья, Волыни и Галичины, где фамилии на -як встречаются особенно часто. В российской традиции подобные фамилии нередко переоформляли в Чоборев или Чоборенко, но Чоборяк сохранил исходную украинскую огласовку.

Не исключена и вторая, менее очевидная версия: в отдельных говорах «чобором» называли не только чабрец, но и сорную траву с сильным запахом, а в переносном смысле — неопрятного или взбалмошного человека. Однако для фамилии такая негативная трактовка маловероятна: прозвища от названий растений чаще давали по ремеслу или месту жительства, а не по характеру. Словарь украинских фамилий Ю. Редько фиксирует Чоборяк именно как производное от «чобір» (чабрец), без указания на уничижительный оттенок.

Географически фамилия тяготеет к западу Украины — в первую очередь к Тернопольской, Хмельницкой и Львовской областям. В России она встречается единично, в основном среди потомков переселенцев из этих регионов. Поскольку фамилия не была распространена в среде дворянства или духовенства, её носители в большинстве своём происходят из крестьянского или казачьего сословия: люди, чей быт был тесно связан с землёй, травами и народной медициной.