Фамилия Чорей — редкая и неочевидная. Её происхождение, скорее всего, не русское, а тюркское или румыно-молдавское, и разбирать её нужно не через привычную модель «отчество от крестильного имени», а через прозвище или этноним.

В тюркских языках (татарском, башкирском, казахском) слово «чорей» или «чурэй» может означать «бедняк», «сирота», «одинокий человек». Прозвище давали тому, кто не имел родни или жил в нужде. Такая основа встречается в фамилиях Чураев, Чурин, Чураков. Чорей — более редкий вариант, где конечное -ей указывает на старую тюркскую огласовку. Если предки были из волжских татар или башкир, фамилия могла закрепиться именно в таком написании при переходе в русские документы.

Вторая версия — румыно-молдавская. В румынском «ciorei» (читается «чорей») — форма множественного числа от «cioară» (ворона). Фамилия могла возникнуть как прозвище черноволосого или смуглого человека, либо как насмешливое — «каркающий», говорливый. В Молдавии и на юго-западе Украины фамилия Чорей встречается чаще, чем в центральной России, что подтверждает эту гипотезу.

Суффикса -ов/-ев в фамилии нет, а окончание -ей типично для фамилий, которые не русифицировались полностью: они остались в форме чистой основы или с тюркским аффиксом. Это говорит о том, что носители фамилии долго сохраняли свой язык и не перешли на русскую модель образования фамилий через отчество.

По сословному составу Чореи могли быть крестьянами или казаками — в реестрах запорожских казаков XVII века встречается имя Чорей как прозвище. В более поздних метриках фамилия фиксируется в Бессарабии, на Херсонщине и в Крыму.

Если искать однокоренные фамилии, то ближе всего Чураев и Чореев — последняя встречается у татар-мишарей. Чорей можно считать либо её усечённой формой, либо самостоятельным прозвищем, которое не обросло русским суффиксом.