Фамилия Човганский — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В отличие от массы фамилий на -ов/-ин, эта образована по модели, типичной для польской и западнорусской шляхты: суффикс -ский указывал на принадлежность к месту или владению. В основе лежит топоним — скорее всего, название населённого пункта вроде Човганы или Човгань. Такие названия встречаются на территории исторической Речи Посполитой, особенно в современной Беларуси и на западе Украины. Первым носителем фамилии был человек, владевший землёй в таком месте или оттуда родом.

Сам корень «човг-» — тёмный. Скорее всего, он имеет балтское или ятвяжское происхождение, что неудивительно для земель, где славяне веками соседствовали с балтскими племенами. Можно предположить связь с литовским словами, означающими нечто острое, колющее (ср. лит. čiaugti — «резать», «рубить»), или с диалектным названием челна-однодеревки (в некоторых говорах «човн» — лодка). Однако вторая версия слабее: от «човн» скорее получилось бы Човненский или Човнин. Правдоподобнее выглядит вариант, что «Човга» — это дохристианское прозвище, возможно, связанное с внешностью или характером, которое затем закрепилось за хутором или урочищем.

В социальном плане Човганские, скорее всего, относились к мелкой шляхте или однодворцам. В Российской империи после разделов Польши многие шляхтичи, не сумевшие подтвердить дворянство, были переведены в податные сословия, но сохранили фамилию. Фамилия не получила широкого распространения — её носители компактно проживают на западе Беларуси и в приграничных районах Польши. Встречается также вариант написания Човганьский, что указывает на двойное произношение в старых документах.

С точки зрения словообразования интересен суффикс -ань-/-ан-, который в основе (Човган) встречается реже, чем, скажем, -ов- или -ин-. Это ещё один аргумент в пользу того, что фамилия не произошла от имени или профессии, а привязана к конкретному месту, название которого само по себе уже было редким.