Фамилия Чубуева образована от прозвища или нецерковного имени Чубуй. В её основе лежит слово «чуб» — прядь волос, хохол, вихор, а также длинный ус. Суффикс -ев указывает на принадлежность: Чубуев буквально значит «сын Чубуя» или «человек из рода Чубуя». Фамилия относится к распространённому типу русских фамилий на -ев, которые возникали от основ на мягкий согласный (чуб → Чубой → Чубуй → Чубуев).

Само прозвище Чубуй могло иметь несколько значений. Самое прямое — человек с заметным, возможно, длинным чубом, который не стригли или специально отпускали. В крестьянской среде чуб считался приметой удали, молодцеватости. Второе значение связано с диалектным словом «чубук» — полый стержень для курения табака. В ряде говоров «чубуем» называли того, кто постоянно курит или носит с собой трубку. Третья версия, менее вероятная, но возможная, — связь с тюркским «чуб» (сор, мусор) или «чубук» (прут, ветка). Однако для русской ономастики более характерна славянская основа.

Географически фамилия Чубуева встречается в центральных и южных регионах России, особенно в Ростовской, Воронежской областях и на Кубани. В этих местах слово «чуб» было в ходу, а фамилия закрепилась за казачьими и крестьянскими родами. Среди однокоренных фамилий — Чубаров, Чубукин, Чубаев, Чубунов. Все они восходят к тому же корню, но различаются суффиксами и диалектными особенностями.

Сословная принадлежность Чубуевых в основном крестьянская и мещанская. В документах XVIII–XIX веков эта фамилия встречается у однодворцев и государственных крестьян, реже — у купцов. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано, что неудивительно: прозвище было слишком «бытовым» и не давало оснований для герба. В целом фамилия Чубуева — типичный пример того, как внешняя примета или привычка человека становилась родовым именем на века.