Фамилия Чубуев образована от прозвища Чубуй. Слово «чубуй» в русских говорах имело несколько значений, но наиболее вероятное исходное — «затычка», «гвоздь» или «колышек». В переносном смысле так могли прозвать невысокого, коренастого человека либо, наоборот, того, кто «затыкал» других — был упрямым, несговорчивым. В некоторых диалектах «чубуй» означал также «чуб» или «хохол», но это значение менее вероятно для основы фамилии: прозвище по прическе чаще давало бы форму Чубаев или Чубунов.

Фамилия построена по самой распространенной русской модели: основа + суффикс -ев. Суффикс -ев, а не -ов, указывает на то, что исходное слово оканчивалось на мягкий или шипящий согласный (Чубуй → Чубуев). Это типичная патронимическая форма, отвечающая на вопрос «чей?»: сын Чубуя, потомок Чубуя. С точки зрения морфологии фамилия прозрачна и не содержит редких или архаичных элементов.

Географически фамилия Чубуев встречается нечасто. Основные очаги бытования — центральные и южные регионы России, особенно Курская, Воронежская и Ростовская области. Там же фиксируются однокоренные фамилии Чубуков, Чубукин, Чубунов, что подтверждает местную корневую основу «чубу-». Встречаемость Чубуева в казачьих областях может указывать на прозвищное происхождение в военной среде: Чубуем могли назвать служилого человека за крепкое сложение или упрямый нрав.

Сословная принадлежность первых носителей фамилии не документирована, но по косвенным данным — по распространению в крестьянской и казачьей среде — Чубуевы относились к податным сословиям. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. В ревизских сказках и исповедных росписях XIX века Чубуевы встречаются как однодворцы и государственные крестьяне.

Известных исторических личностей с фамилией Чубуев нет: это редкая, «тихая» фамилия, не попавшая в энциклопедии. Но именно благодаря редкости она хорошо сохранила связь с исходным прозвищем — в ней слышен тот самый «чубуй», колышек или затычка, который дал имя своему хозяину.