Фамилия Чудакова происходит от прозвища Чудак, в основе которого, возможно, лежит аналогичное нарицательное. Чудаком могли прозвать человека странного, оригинального, делающего все по-своему, а не так, как принято. Соответственно, прозвище Чудак могло указывать на особенности характера предка. Даля есть слово «чудаки», которому дается следующее определение: «Народ дикарь, живший, по преданию, в Сибири, и оставивший по себе одну лишь память в буграх (курганах, могилах); испугавшись Ермака и внезапно явившейся с ним белой березы, признака власти белого царя, чудь или чудаки вырыли подкопы, ушли туда со всем добром, подрубили стойки и погибли». В древнерусских летописях чудью (или чухонцами) называли эстонцев и родственные им прибалтийские племена, жившие во владениях Великого Новгорода и близ Онежского озера. Поэтому не исключено, что прозвище Чудак указывало на этническую принадлежность предка. В поверьях и преданиях чудь наделялась необычными или сверхъестественными чертами, способностями. Так и прозвище Чудак закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Чудакова. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Чудак, со временем получил фамилию Чудакова. Среди известных представителей фамилии — Евгений Алексеевич Чудаков (1890—1953), российский ученый, академик, один из основоположников автомобилестроения; Сергей Иванович Чудаков (1937—?), русский поэт; Александр Павлович Чудаков (1938—2005), российский литературовед и писатель.