Фамилию Чудановских не стоит путать с фамилией Чудановский, хотя корень у них общий. Разница в суффиксе принципиальна: окончание -ских указывает на то, что перед нами фамилия, возникшая в северных и центральных губерниях России, а также в Сибири, где была распространена модель образования фамилий на -их, -ых. Это так называемые «семейные» фамилии, которые отвечали на вопрос «чьи?» — то есть «Чудановских» буквально означало «из семьи Чудановых». Позже, при унификации документов, форма «Чудановских» могла закрепиться как неизменяемая.

Основа фамилии — прозвище или мирское имя Чудан. Оно образовано от слова «чудо» или «чудак». В древнерусской традиции имя Чудан давали не в насмешку, а как оберег: считалось, что «странное» имя отпугнет злых духов и ребенка не сглазят. Чуданом могли назвать человека с необычной внешностью, поведением или просто родившегося в необычный день. Встречается и другая версия: Чудан — это производное от крестильного имени Феодор (в народной форме Худор, Чудор), но она менее вероятна, так как суффикс -ан типичен именно для прозвищ.

Фамилия Чудановских — редкая даже по меркам русских фамилий на -ских. Она практически не встречается в центральных дворянских родословных, что указывает на крестьянское или мещанское происхождение носителей. Поскольку суффикс -ских закрепился чаще всего у переселенцев, можно предположить, что предки Чудановских ушли на новые земли (например, за Урал или в Сибирь) в XVII–XVIII веках, где и получили фамилию по отцу: «Чуданов сын» превратилось в «Чудановских», то есть «из рода Чудана».

Интересно, что фамилия сохранила архаичную грамматическую форму: в отличие от «Чудановского», она не склоняется по падежам (как и все фамилии на -их, -ых). Это одна из немногих живых примет северорусской ономастической традиции, которая в XX веке почти исчезла под давлением стандартизации паспортной системы.