Фамилия Чундаев — редкий случай, где основа почти наверняка не русская, а тюркская или монгольская, и разобрать её стоит именно с этого угла. В русских фамилиях суффикс -ев указывает на происхождение от имени или прозвища, оканчивающегося на мягкий согласный или -й. Корень здесь — Чундай.

Самая вероятная версия: Чундай — это адаптированное тюркское личное имя Чондай или Чундай. В тюркских языках «чон» (или «чун») означает «большой», «старший», «великий». Суффикс -дай/ -дей — распространённый формант, образующий имена со значением «подобный», «обладающий качеством». То есть Чундай — «подобный великому», «большак», «старшак». Такие имена давали в знак уважения или как пожелание ребёнку вырасти сильным и влиятельным. В русских документах XVI–XVII веков фиксируются люди с именем Чундай (например, в казанских и астраханских переписях), и фамилия Чундаев могла образоваться у их потомков, перешедших в православие.

Менее вероятная, но не исключённая версия — связь с монгольским словом «чунда» (или «чундай») со значением «светлый», «ясный». В этом случае прозвище могло характеризовать человека со светлыми волосами или открытым, честным нравом. Однако тюркская версия подкрепляется большей распространённостью подобных имён в Поволжье и Приуралье — зоне активных контактов русских с татарами, башкирами и чувашами.

Географически фамилия Чундаев встречается нечасто, но заметна именно в этих регионах: в Башкортостане, Татарстане, Оренбургской и Челябинской областях. Это косвенно подтверждает её происхождение от тюркского имени, бытовавшего в среде служилых татар или башкир, которые после крещения получали фамилии по отцу.

Словообразовательная модель проста: к основе Чундай добавили типичный русский патронимический суффикс -ев, что означает «сын Чундая». Фамилия не получила широкого распространения, поэтому её носители, скорее всего, происходят из одного или нескольких родственных родов, а не из разных, случайно совпавших линий.