Фамилия Чупахин происходит от прозвища Чупаха. Это слово в старину означало «грязнуля» или «неряха». Кроме того, в нижегородском диалекте чупахой называли неопрятную женщину или обрусевшую мордовку. Таким образом, это прозвище могло указывать на национальность человека, его внешность или поведение. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Чупаха, со временем получил фамилию Чупахин.